新疆大學數(shù)學與系統(tǒng)科學學院的前身是1952年新疆民族學院時成立的數(shù)理系。1962年成立了新疆大學數(shù)學系，2001年5月成立了新疆大學數(shù)學與系統(tǒng)科學學院。
　　新疆大學數(shù)學與系統(tǒng)科學學院自1957年招收第一屆本科生以來，在新疆數(shù)學界元老陳德璜教授、王曾貽教授的帶領下，在張華孝、盛其榮、張知難等教授的共同努力下，新疆大學數(shù)學系全面進入了本科層次，建立了基礎數(shù)學和計算數(shù)學的本科專業(yè)，并于1981年建立了基礎數(shù)學碩士點。80年代初期至90年代中期，化學圖論專家張�；�教授開創(chuàng)了新疆大學的圖論研究工作，同時開始了學科建設工作，并建立了應用數(shù)學碩士點。1991年基礎數(shù)學被確定為自治區(qū)首批重點學科，相繼獲得了和應用數(shù)學和計算數(shù)學碩士點。90年代中后期至今，孟吉翔教授和韓東教授堅持了學科建設的正確方向，建立了統(tǒng)計學本科專業(yè)，合并基礎數(shù)學、應用數(shù)學建立了數(shù)學與應用數(shù)學本科專業(yè)；將計算數(shù)學發(fā)展為信息與計算科學本科專業(yè)。并在學科建設上有了重大的發(fā)展，建立了數(shù)學博士后流動站、應用數(shù)學博士點、應用數(shù)學國家級重點學科、運籌學與控制論碩士點、概率論與數(shù)理統(tǒng)計碩士點、應用數(shù)學國家第三批高等學校特色專業(yè)建設點、數(shù)學與應用數(shù)學國家級理科培養(yǎng)基地。
　　新疆大學數(shù)學與系統(tǒng)科學學院現(xiàn)已擁有數(shù)學與應用數(shù)學、信息與計算科學、統(tǒng)計學三個本科專業(yè)，應用數(shù)學、基礎數(shù)學、計算數(shù)學、運籌學與控制論、概率論與數(shù)理統(tǒng)計五個碩士點，應用數(shù)學博士點，數(shù)學學科博士后科研流動站，以及“數(shù)學與應用數(shù)學”國家人才培養(yǎng)理科基地。“應用數(shù)學”為國家級重點學科和新疆大學“211工程”重點學科，“數(shù)學與應用數(shù)學”是國家級優(yōu)勢特色學科。形成了可培養(yǎng)各民族本科、碩士、博士和博士后四個層次的數(shù)學專門人才的一條龍教育體系。
　　新疆大學數(shù)學與系統(tǒng)科學學院現(xiàn)有教職工120余人，其中博士生導師8人,碩士生導師26人，教授17人，副教授41人，有博士學位的教師40人。享受政府津貼專家1人，自治區(qū)有突出貢獻優(yōu)秀專家2人，自治區(qū)教學名師3人，百千萬工程人才1人，新世紀優(yōu)秀人才支持計劃1人，天山學者2人。